Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms