Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC24Q8N4L8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC24Q8N4L8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC24Q8N4L8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC24Q8N4L8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC24Q8N4L8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms