Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP4Q8N2S1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP4Q8N2S1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP4Q8N2S1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP4Q8N2S1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP4Q8N2S1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms