Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms