Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms