Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKL3Q8IVW4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms