Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLNKQ7Z7G1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLNKQ7Z7G1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms