Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms