Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9AQ7Z3C6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms