Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms