Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM47EQ6ZV65 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms