Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRAIDQ6UW56 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms