Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms