Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms