Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.354e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.664e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.664e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 KIF1B-210ENST00000497835 452 ntTSL 36.03□□□□□ -1.441e-11■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 HTT-207ENST00000509751 723 ntTSL 312.71□□□□□ -0.371e-15■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-213ENST00000512031 2467 ntTSL 57.19□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.096e-15■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS4-202ENST00000524766 556 ntTSL 37.59□□□□□ -1.196e-15■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS4-210ENST00000534408 1681 ntTSL 26.82□□□□□ -1.326e-15■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 TRMU-215ENST00000486620 814 ntTSL 313.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 TRMU-213ENST00000485175 731 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 EPHX2-210ENST00000521924 488 ntTSL 27.08□□□□□ -1.284e-35■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 AC092587.1-201ENST00000410042 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.842e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 MRPL30-204ENST00000465432 1752 ntTSL 57.76□□□□□ -1.172e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.342e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 MRPL30-205ENST00000473743 567 ntTSL 53.26□□□□□ -1.892e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.42e-12■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 29.99□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX42-207ENST00000578593 2919 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-13■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 37.15□□□□□ -1.272e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 31.54□□□□□ -2.162e-9■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 SIK3-208ENST00000472648 267 ntTSL 35.56□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 SEPT2-236ENST00000476841 304 ntTSL 32.71□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX39A-208ENST00000588692 1478 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 CRY2-209ENST00000532390 535 ntTSL 416.17■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 CRY2-206ENST00000496571 563 ntTSL 316.17■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 DAXX-210ENST00000490173 641 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.329e-7■■■■■ 34.4
PRPF8Q6P2Q9 SMOC1-203ENST00000553839 551 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 SPEN-202ENST00000438066 1733 ntTSL 34.76□□□□□ -1.656e-12■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-207ENST00000498706 4674 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-203ENST00000409183 1874 ntTSL 23.71□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-201ENST00000238181 819 ntTSL 511.32□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-206ENST00000366584 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-207ENST00000406509 1035 ntTSL 58.71□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-205ENST00000366583 1547 ntTSL 38.66□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.566e-7■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-224ENST00000528782 572 ntTSL 42.85□□□□□ -1.956e-7■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 ZFYVE19-207ENST00000563497 452 ntTSL 212.91□□□□□ -0.346e-21■■■■■ 34.3
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PRPF8Q6P2Q9 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 54.95□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 WDR26-204ENST00000477425 529 ntTSL 33.54□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TTLL5-202ENST00000298832 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 26.12□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 25.35□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TOE1-203ENST00000471337 1074 ntTSL 312.27□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TOE1-205ENST00000495703 2173 ntTSL 211.4□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 MYH10-211ENST00000584124 317 ntTSL 35.28□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 316.1■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-203ENST00000465629 2108 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-205ENST00000472680 440 ntTSL 312.02□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-206ENST00000477307 1293 ntTSL 410.24□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF103-202ENST00000463333 686 ntTSL 58.64□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 CLMN-204ENST00000555615 685 ntTSL 57.46□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 CLMN-203ENST00000555336 718 ntTSL 54.33□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TLK1-207ENST00000453628 539 ntTSL 43.41□□□□□ -1.864e-10■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 TLK1-211ENST00000486857 715 ntTSL 32.23□□□□□ -2.054e-10■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 28.81□□□□□ -12e-13■■■■■ 34.3
PRPF8Q6P2Q9 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 26.32□□□□□ -1.42e-13■■■■■ 34.3
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