Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED27Q6P2C8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED27Q6P2C8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms