Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KANK3Q6NY19 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms