Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms