Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms