Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms