Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms