Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms