Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms