Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPRD2Q5VT52 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms