Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VSD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms