Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms