Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL12Q53G59 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms