Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms