Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF8Q3BBV2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms