Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf21Q32NC0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf21Q32NC0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms