Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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