Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HADHQ16836 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HADHQ16836 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HADHQ16836 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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