Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms