Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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