Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYPL1Q16563 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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