Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms