Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms