Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SHPRHQ149N8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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