Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ODF1Q14990 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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