Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCINQ13939 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCINQ13939 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCINQ13939 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCINQ13939 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCINQ13939 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms