Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXOSC2Q13868 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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