Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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