Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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