Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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