Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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