Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
UBE2V1Q13404 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
UBE2V1Q13404 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms