Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP140Q13342 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SP140Q13342 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP140Q13342 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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