Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRSQ13332 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRSQ13332 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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