Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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