Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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